Bio-informaticus

Om de groei van onze eenheid Computational Biology te ondersteunen, zijn we op zoek naar een zeer gemotiveerde en gekwalificeerde bio-informaticus, gespecialiseerd in vergelijkende genomica en long-read sequencing, om ons team te versterken en een cruciale rol te spelen in onze onderzoeks- en ontwikkelingsinspanningen. 👩‍🔬

De bio-informaticus die gespecialiseerd is in nanopore sequencing en vergelijkende genomica zal een cruciale rol spelen bij het vergroten van ons begrip van genomische functies en structuren binnen schimmel- en bacteriestammen, die essentieel zijn voor innovatieve bioraffinage- en bioremediatieprocessen. Deze functie vereist diepgaande expertise op het gebied van genomica, met name in de analyse van lange sequencing-lezingen met behulp van Nanopore-technologie en de uitvoering van vergelijkende genomische studies. 📊

De succesvolle kandidaat zal verantwoordelijk zijn voor het uitvoeren van diepgaande literatuuronderzoeken, datamining en evolutionaire analyse om genen te identificeren en te interpreteren die cruciaal zijn voor bioraffinage en bioremediatietoepassingen. Daarnaast zullen ze de assemblage van sequentiegegevens, kwaliteitscontrole en functionele annotatie beheren, en zo een belangrijke bijdrage leveren aan de verrijking van de MycoBank-database. De ideale kandidaat heeft een sterke achtergrond in bio-informatica of een nauw verwant vakgebied, gekoppeld aan bewezen ervaring in een dynamische en collaboratieve onderzoeksomgeving.

👉 Verantwoordelijkheden: Nanopore Sequencing

Kwaliteitscontrole van sequencing-lezingen

• Het uitvoeren van eerste kwaliteitsbeoordelingen op lange sequencing-metingen verkregen via Nanopore-technologie

• Gebruik bio-informaticatools om gegevens te filteren en op te schonen, zodat u hoogwaardige input krijgt voor verdere analyse.

Assemblage en annotatie

• Het samenvoegen van gereinigde longreads tot een coherente genomische sequentie

• Voer functionele genoomannotatie uit om genen te identificeren en te categoriseren op basis van hun voorspelde functies

Samenwerking aan de MycoBank-database

• Werk samen met een team om sequentiegegevens te integreren in de MycoBank-database

• Ervoor zorgen dat de gegevens goed georganiseerd en toegankelijk zijn, waardoor het nut van de database voor de interne ontwikkeling van Novobiom wordt verbeterd

👉 Verantwoordelijkheden: Vergelijkende genomica

Documentair onderzoek en datamining

• Het bestuderen van de bestaande literatuur om genen te identificeren die betrokken zijn bij kritieke bioraffinage- en bioremediatieprocessen

• Gebruik dataminingtechnieken om resultaten met betrekking tot belangrijke enzymstappen en metabole routes te consolideren en samen te vatten

Studie van evolutionaire paden

• Analyse van de evolutionaire geschiedenis van specifieke genen in schimmel- en bacteriestammen

• Gebruik fylogenetische hulpmiddelen en databases om genevolutie te volgen en functionele aanpassingen te begrijpen

Gegevensanalyse en -interpretatie

• Samenwerken aan verschillende projecten voor genetische data-analyse, onderzoek naar modellen en informatie met betrekking tot de bioraffinaderij

• Gebruik statistische hulpmiddelen en bio-informaticasoftware om resultaten te interpreteren en bij te dragen aan wetenschappelijke discussies

🎓 Vorming:

Masterdiploma of hoger in bio-informatica, computationele biologie, genomica of een gerelateerd vakgebied.

🔬 Technische expertise:

• Bedreven in programmeertalen zoals Python voor bio-informaticaanalyse

• Geavanceerde kennis van bash-scripts, versiebeheersystemen zoals Git en ervaring met het bouwen van bio-informaticapijplijnen

• Hands-on ervaring met Nanopore sequencing data-analyse en bekendheid met bijbehorende bio-informatica tools en platforms

👩 🔬 Deskundigheid:

• Diepgaand begrip van vergelijkende genomica, fylogenetica en evolutionaire biologie

• Bekendheid met essentiële biologische databases voor genomica en metabole modellering, zoals KEGG-, MetaCyc-, NCBI-, UniProt- en BiGG-modellen

• Ervaring met het verzamelen, annoteren en beoordelen van de kwaliteit van genomische gegevens

🔎 Onderzoeksvaardigheden:

• Sterke achtergrond in microbiële genomica of bodemmicrobiologie, met een bijzondere interesse in sequencingtechnologieën van de derde generatie

• Mogelijkheid om zelfstandig literatuuronderzoek en datamining uit te voeren ter ondersteuning van genomics-onderzoek en pathway-analyse.

📊 Analytische vaardigheden:

Uitzonderlijk analytisch en probleemoplossend vermogen, met bewezen ervaring in het interpreteren van complexe genomische gegevens

🤝 Communicatieve vaardigheden:

• Uitstekende communicatie- en presentatievaardigheden, in staat om resultaten effectief te presenteren aan een wetenschappelijk en niet-wetenschappelijk publiek

• Ervaring met het schrijven van wetenschappelijke artikelen of rapporten en het bijdragen aan gezamenlijke onderzoeksprojecten

• Vloeiend in het Engels

• Aantoonbaar vermogen om effectief te werken in een dynamische en collaboratieve omgeving, bij voorkeur in een start-up- of onderzoekscontext

1. Een screening met onze HR-manager

2. Een interview met onze manager Bioinformatica

3. Laatste interview met onze COO en CEO over waarden en cultuur

4. Laten we beginnen! 🚀